Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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