Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FBXO40Q9UH90 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms