Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms