Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms