Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFIP11Q9UBB9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms