Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms