Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRMT1Q9NXH9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMT1Q9NXH9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms