Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms