Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms