Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PKDREJQ9NTG1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms