Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMSN1Q9NSI8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms