Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYLDQ9NQC7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
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