Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms