Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms