Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDCBP2Q9H190 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDCBP2Q9H190 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDCBP2Q9H190 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDCBP2Q9H190 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDCBP2Q9H190 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms