Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NYXQ9GZU5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms