Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCGF6Q9BYE7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms