Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRIP1Q9BX63 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms