Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SSBP4Q9BWG4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SSBP4Q9BWG4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SSBP4Q9BWG4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SSBP4Q9BWG4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SSBP4Q9BWG4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SSBP4Q9BWG4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSBP4Q9BWG4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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