Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD2AQ9BW72 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms