Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB2BQ9BVA1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms