Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF4Q9BUZ4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms