Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTA3Q9BTC8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTA3Q9BTC8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms