Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms