Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms