Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms