Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF4Q96M43 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF4Q96M43 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms