Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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