Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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TRIM63Q969Q1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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TRIM63Q969Q1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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TRIM63Q969Q1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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TRIM63Q969Q1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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