Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms