Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

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Length 1,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP7Q93009 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP7Q93009 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP7Q93009 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP7Q93009 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP7Q93009 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP7Q93009 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP7Q93009 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP7Q93009 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP7Q93009 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP7Q93009 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP7Q93009 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP7Q93009 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP7Q93009 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP7Q93009 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP7Q93009 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP7Q93009 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP7Q93009 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP7Q93009 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP7Q93009 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP7Q93009 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP7Q93009 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP7Q93009 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP7Q93009 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP7Q93009 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP7Q93009 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP7Q93009 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP7Q93009 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP7Q93009 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP7Q93009 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP7Q93009 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP7Q93009 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP7Q93009 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP7Q93009 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP7Q93009 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP7Q93009 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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USP7Q93009 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP7Q93009 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP7Q93009 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP7Q93009 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP7Q93009 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP7Q93009 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP7Q93009 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP7Q93009 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP7Q93009 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP7Q93009 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP7Q93009 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP7Q93009 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP7Q93009 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP7Q93009 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP7Q93009 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP7Q93009 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP7Q93009 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP7Q93009 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP7Q93009 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP7Q93009 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP7Q93009 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP7Q93009 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP7Q93009 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP7Q93009 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP7Q93009 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP7Q93009 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP7Q93009 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP7Q93009 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP7Q93009 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP7Q93009 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP7Q93009 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP7Q93009 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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