Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RGP1Q92546 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms