Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCSTNQ92542 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCSTNQ92542 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms