Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms