Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ0

DUSP18, Dual specificity protein phosphatase 18, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18Q8NEJ0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP18Q8NEJ0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms