Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms