Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HJURPQ8NCD3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms