Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms