Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms