Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC149Q6ZUS6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC149Q6ZUS6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms