Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG3Q6UXM1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms