Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BLOC1S2Q6QNY1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BLOC1S2Q6QNY1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms