Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms