Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSBN1Q5VWQ0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms