Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWK0

NBPF6, Neuroblastoma breakpoint family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF6Q5VWK0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF6Q5VWK0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF6Q5VWK0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms