Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms