Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF20Q5VTR2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms