Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDGFL1Q5TGJ6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms