Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms