Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PERM1Q5SV97 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms